5.2.6 : Le hadamard_singularity.submit
On commence par définir le script de notre job :
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executable=singularity_run.sh
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Ensuite, on définit l'environment dans lequel on lance le job (sur MUST ce sera toujours vanilla pour le moment et il faut toujours le spécifier sinon ça plante) :
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universe=vanilla
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On peut passer quelques arguments à notre programme :
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arguments=Example.$(Cluster).$(Process) 100 |
On définit les sorties, les erreurs et les logs :
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output=results.output.$(Process) error=results.error.$(Process) log=results.log |
On peut recevoir un e-mail de notification quand le job est terminé :
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notification=complete notify_user=name.surname@lapp.in2p3.fr |
On peut transmettre l'environnement au job (même si ce n'est pas toujours une bonne idée) :
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getenv = True # Pour transmettre certaines variable d'environnement au job #environment = one=1;two=2;three="quotes have no 'special' meaning" |
On peut transférer des fichiers sur demande (mais nous n'en avons pas besoin) :
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should_transfer_files=IF_NEEDED when_to_transfer_output = ON_EXIT |
On spécifie les ressources necéssaires au fonctionnement de notre programme :Le nombre de coeurs CPU noteOui, ça s'appelle request_cpus mais il s'agit bien d'un nombre de coeurs et non d'un nombre de CPU :
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request_cpus = 1 |
La mémoire RAM dont nous aurons besoin (par défaut 1 Go/CPU, enfin par coeur) :
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request_memory = 1024 #default request_diskvalue : 0, il utilise le minimum possible) espace LOCAL au noeud # request_disk = 10240 |
On peut spécifier le nombre de jobs que l'on veut lancer en parallèle (Attention : il faut toujours ajouter queue sinon ne job ne partira pas) :
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queue 1 |
Le hadamard_singularity.submit complet :
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executable=singularity_run.sh universe=vanilla arguments=Example.$(Cluster).$(Process) 100 output=results.output.$(Process) error=results.error.$(Process) log=results.log notification=complete notify_user=name.surname@lapp.in2p3.fr getenv = True # Pour transmettre certaines variable d'environnement au job #environment = one=1;two=2;three="quotes have no 'special' meaning" should_transfer_files=IF_NEEDED when_to_transfer_output = ON_EXIT request_cpus = 1 request_memory = 1024 #default request_diskvalue : 0, il utilise le minimum possible) espace LOCAL au noeud # request_disk = 10240 queue 1 |